??????? 17日,記者從浙江省農(nóng)科院獲悉,,該院水生生物研究所小黃魚科研團隊與美國奧本大學,、廈門大學合作,首次完成小黃魚全基因組組裝注釋與精細圖譜繪制,,為建立小黃魚基因組選擇育種,、培育高產(chǎn)抗病優(yōu)質(zhì)良種提供了基因資源和技術手段,相關研究論文近日在線發(fā)表于學術期刊《分子生態(tài)學資源》上,。
??????? 小黃魚是中國重要的海產(chǎn)經(jīng)濟魚,,味道鮮美,,廣受青睞。2021年,,浙江省農(nóng)科院等單位通過連續(xù)8年產(chǎn)學研聯(lián)合攻關,,突破了野生小黃魚馴活、人工催產(chǎn)和全人工規(guī)?;庇P鍵技術,,實現(xiàn)小黃魚網(wǎng)箱養(yǎng)殖規(guī)模化生產(chǎn),。隨著小黃魚全養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的擴大和科研的深入,,破譯小黃魚基因組,發(fā)掘生長,、性別決定等相關重要功能基因成為擺在科研工作者面前的重要課題,。
全人工養(yǎng)殖的小黃魚 科研團隊供圖
??????? “黃魚屬擁有東海四大海產(chǎn)中的小黃魚與大黃魚兩個重要經(jīng)濟魚類,雖然它們形態(tài)和染色體核型相似,,但是黃魚屬物種之間的遺傳關系尚未明確,。”論文第一作者,、浙江省農(nóng)科院水生所助理研究員謝慶平博士介紹,,本研究通過結(jié)合四類基因組測序技術,構(gòu)建了小黃魚染色體水平的基因組精細圖譜,;揭示小黃魚基因組大小為706 Mb,,注釋基因為25233個;進化分析表明小黃魚與大黃魚親緣關系最近,,大概在2540萬年前開始分化,。
??????? 謝慶平介紹,魚類雌雄同體和雌雄異體的演化方向,,在學術界仍然是一個有待解決的有趣謎團,。此次研究通過轉(zhuǎn)錄組學、比較基因組學以及分子生物學的技術方法,,鑒定出dmrt1基因為小黃魚的雄性特異性基因,,且dmrt1基因序列的演化可以作為魚類中雌雄同體現(xiàn)象產(chǎn)生的生物標記。
??????? 論文通訊作者,、浙江省農(nóng)科院水生所所長樓寶研究員表示,,小黃魚全基因組的解譯和基因組精細圖譜的繪制,對于海洋漁業(yè)資源保護,、小黃魚養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)化以及分子遺傳育種技術的研究意義重大,,可以為科研人員開展小黃魚種質(zhì)資源挖掘保護、經(jīng)濟性狀的遺傳解析和建立以基因組為基礎的輔助育種平臺,。