??????? 17日,,記者從浙江省農(nóng)科院獲悉,,該院水生生物研究所小黃魚科研團(tuán)隊(duì)與美國(guó)奧本大學(xué),、廈門大學(xué)合作,,首次完成小黃魚全基因組組裝注釋與精細(xì)圖譜繪制,為建立小黃魚基因組選擇育種,、培育高產(chǎn)抗病優(yōu)質(zhì)良種提供了基因資源和技術(shù)手段,,相關(guān)研究論文近日在線發(fā)表于學(xué)術(shù)期刊《分子生態(tài)學(xué)資源》上。
??????? 小黃魚是中國(guó)重要的海產(chǎn)經(jīng)濟(jì)魚,,味道鮮美,,廣受青睞。2021年,,浙江省農(nóng)科院等單位通過(guò)連續(xù)8年產(chǎn)學(xué)研聯(lián)合攻關(guān),,突破了野生小黃魚馴活、人工催產(chǎn)和全人工規(guī)?;庇P(guān)鍵技術(shù),,實(shí)現(xiàn)小黃魚網(wǎng)箱養(yǎng)殖規(guī)模化生產(chǎn)。隨著小黃魚全養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的擴(kuò)大和科研的深入,,破譯小黃魚基因組,,發(fā)掘生長(zhǎng)、性別決定等相關(guān)重要功能基因成為擺在科研工作者面前的重要課題,。
全人工養(yǎng)殖的小黃魚 科研團(tuán)隊(duì)供圖
??????? “黃魚屬擁有東海四大海產(chǎn)中的小黃魚與大黃魚兩個(gè)重要經(jīng)濟(jì)魚類,,雖然它們形態(tài)和染色體核型相似,但是黃魚屬物種之間的遺傳關(guān)系尚未明確,。”論文第一作者,、浙江省農(nóng)科院水生所助理研究員謝慶平博士介紹,,本研究通過(guò)結(jié)合四類基因組測(cè)序技術(shù),構(gòu)建了小黃魚染色體水平的基因組精細(xì)圖譜,;揭示小黃魚基因組大小為706 Mb,,注釋基因?yàn)?5233個(gè);進(jìn)化分析表明小黃魚與大黃魚親緣關(guān)系最近,,大概在2540萬(wàn)年前開(kāi)始分化,。
??????? 謝慶平介紹,魚類雌雄同體和雌雄異體的演化方向,,在學(xué)術(shù)界仍然是一個(gè)有待解決的有趣謎團(tuán),。此次研究通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)、比較基因組學(xué)以及分子生物學(xué)的技術(shù)方法,,鑒定出dmrt1基因?yàn)樾↑S魚的雄性特異性基因,,且dmrt1基因序列的演化可以作為魚類中雌雄同體現(xiàn)象產(chǎn)生的生物標(biāo)記。
??????? 論文通訊作者,、浙江省農(nóng)科院水生所所長(zhǎng)樓寶研究員表示,,小黃魚全基因組的解譯和基因組精細(xì)圖譜的繪制,對(duì)于海洋漁業(yè)資源保護(hù),、小黃魚養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)化以及分子遺傳育種技術(shù)的研究意義重大,,可以為科研人員開(kāi)展小黃魚種質(zhì)資源挖掘保護(hù)、經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳解析和建立以基因組為基礎(chǔ)的輔助育種平臺(tái),。